MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus barophilus MP plasmid pTBMP1

Total Repeats: 960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015471	TCT	2	6	29	34	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746791
2	NC_015471	ATT	2	6	53	58	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746791
3	NC_015471	T	6	6	123	128	0 %	100 %	0 %	0 %	331746791
4	NC_015471	TCT	2	6	158	163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746791
5	NC_015471	TA	3	6	204	209	50 %	50 %	0 %	0 %	331746791
6	NC_015471	TAATA	2	10	270	279	60 %	40 %	0 %	0 %	331746791
7	NC_015471	ACG	2	6	306	311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331746791
8	NC_015471	AGA	2	6	379	384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746791
9	NC_015471	A	6	6	412	417	100 %	0 %	0 %	0 %	331746791
10	NC_015471	CAA	2	6	516	521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746791
11	NC_015471	AT	3	6	528	533	50 %	50 %	0 %	0 %	331746791
12	NC_015471	TCA	2	6	590	595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746791
13	NC_015471	T	6	6	674	679	0 %	100 %	0 %	0 %	331746791
14	NC_015471	CT	3	6	685	690	0 %	50 %	0 %	50 %	331746791
15	NC_015471	AT	3	6	781	786	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
16	NC_015471	TCT	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
17	NC_015471	T	7	7	825	831	0 %	100 %	0 %	0 %	331746792
18	NC_015471	TCG	2	6	862	867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331746792
19	NC_015471	TTA	2	6	910	915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746792
20	NC_015471	GTA	2	6	962	967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746792
21	NC_015471	AAAT	2	8	976	983	75 %	25 %	0 %	0 %	331746792
22	NC_015471	AT	3	6	987	992	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
23	NC_015471	T	6	6	1029	1034	0 %	100 %	0 %	0 %	331746792
24	NC_015471	CT	3	6	1128	1133	0 %	50 %	0 %	50 %	331746792
25	NC_015471	AGT	2	6	1146	1151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746792
26	NC_015471	ATC	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746792
27	NC_015471	TA	3	6	1195	1200	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
28	NC_015471	CAG	2	6	1206	1211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331746792
29	NC_015471	TAA	2	6	1230	1235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746792
30	NC_015471	TAA	2	6	1240	1245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746792
31	NC_015471	T	6	6	1294	1299	0 %	100 %	0 %	0 %	331746792
32	NC_015471	ACA	2	6	1300	1305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746792
33	NC_015471	TGTCT	2	10	1337	1346	0 %	60 %	20 %	20 %	331746792
34	NC_015471	TCT	2	6	1370	1375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
35	NC_015471	AGT	2	6	1397	1402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746792
36	NC_015471	TTG	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746792
37	NC_015471	CAA	2	6	1430	1435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746792
38	NC_015471	TGTT	2	8	1440	1447	0 %	75 %	25 %	0 %	331746792
39	NC_015471	TTG	2	6	1550	1555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746792
40	NC_015471	CAT	2	6	1583	1588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746792
41	NC_015471	AT	3	6	1613	1618	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
42	NC_015471	T	6	6	1697	1702	0 %	100 %	0 %	0 %	331746792
43	NC_015471	AT	3	6	1764	1769	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
44	NC_015471	TAT	2	6	1812	1817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746792
45	NC_015471	AAG	2	6	1891	1896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746792
46	NC_015471	CCA	2	6	1963	1968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331746792
47	NC_015471	GAAT	2	8	2007	2014	50 %	25 %	25 %	0 %	331746792
48	NC_015471	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
49	NC_015471	TAT	2	6	2055	2060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746792
50	NC_015471	ATA	2	6	2078	2083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746792
51	NC_015471	TGG	2	6	2094	2099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331746792
52	NC_015471	TAT	3	9	2106	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746792
53	NC_015471	CTT	2	6	2126	2131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
54	NC_015471	ATCC	2	8	2137	2144	25 %	25 %	0 %	50 %	331746792
55	NC_015471	TCG	2	6	2182	2187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331746792
56	NC_015471	TCT	2	6	2201	2206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
57	NC_015471	TAA	2	6	2234	2239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746792
58	NC_015471	CTT	2	6	2316	2321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
59	NC_015471	GTT	2	6	2328	2333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746792
60	NC_015471	TA	3	6	2336	2341	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
61	NC_015471	GAG	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	331746792
62	NC_015471	TTC	2	6	2406	2411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
63	NC_015471	CTTT	2	8	2414	2421	0 %	75 %	0 %	25 %	331746792
64	NC_015471	ACCC	2	8	2550	2557	25 %	0 %	0 %	75 %	331746792
65	NC_015471	CTT	2	6	2763	2768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
66	NC_015471	GAG	2	6	2775	2780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	331746792
67	NC_015471	A	6	6	2857	2862	100 %	0 %	0 %	0 %	331746792
68	NC_015471	CAA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746792
69	NC_015471	CTT	2	6	2969	2974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
70	NC_015471	CTT	2	6	2979	2984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
71	NC_015471	ACA	2	6	2989	2994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746792
72	NC_015471	CTT	2	6	3029	3034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
73	NC_015471	TAG	2	6	3043	3048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746792
74	NC_015471	TTA	2	6	3086	3091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746792
75	NC_015471	TTC	2	6	3132	3137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
76	NC_015471	TC	3	6	3168	3173	0 %	50 %	0 %	50 %	331746792
77	NC_015471	TGA	2	6	3182	3187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746792
78	NC_015471	TTC	2	6	3189	3194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
79	NC_015471	ACC	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331746792
80	NC_015471	TCT	2	6	3310	3315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
81	NC_015471	GAA	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746792
82	NC_015471	GTA	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746792
83	NC_015471	AATC	2	8	3462	3469	50 %	25 %	0 %	25 %	331746792
84	NC_015471	AAC	2	6	3480	3485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746792
85	NC_015471	TCT	3	9	3502	3510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
86	NC_015471	GTT	2	6	3549	3554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746792
87	NC_015471	T	7	7	3561	3567	0 %	100 %	0 %	0 %	331746792
88	NC_015471	GTC	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331746792
89	NC_015471	TC	3	6	3659	3664	0 %	50 %	0 %	50 %	331746792
90	NC_015471	TAA	2	6	3665	3670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746792
91	NC_015471	TA	3	6	3687	3692	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
92	NC_015471	CT	3	6	3741	3746	0 %	50 %	0 %	50 %	331746792
93	NC_015471	TAT	2	6	3768	3773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746792
94	NC_015471	TC	3	6	3784	3789	0 %	50 %	0 %	50 %	331746792
95	NC_015471	GA	3	6	3793	3798	50 %	0 %	50 %	0 %	331746792
96	NC_015471	ATCT	2	8	3819	3826	25 %	50 %	0 %	25 %	331746792
97	NC_015471	TAT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746792
98	NC_015471	ATA	2	6	3861	3866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746792
99	NC_015471	AAG	2	6	3867	3872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746792
100	NC_015471	TCT	2	6	3921	3926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
101	NC_015471	TTGA	2	8	3945	3952	25 %	50 %	25 %	0 %	331746792
102	NC_015471	CAC	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331746792
103	NC_015471	GTT	2	6	4043	4048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746792
104	NC_015471	T	7	7	4052	4058	0 %	100 %	0 %	0 %	331746792
105	NC_015471	CTA	2	6	4066	4071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746792
106	NC_015471	TGC	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331746792
107	NC_015471	TCT	2	6	4239	4244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746792
108	NC_015471	ATTT	2	8	4272	4279	25 %	75 %	0 %	0 %	331746792
109	NC_015471	T	6	6	4321	4326	0 %	100 %	0 %	0 %	331746792
110	NC_015471	CT	3	6	5196	5201	0 %	50 %	0 %	50 %	331746793
111	NC_015471	CTTT	2	8	5222	5229	0 %	75 %	0 %	25 %	331746793
112	NC_015471	AAC	2	6	5250	5255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331746793
113	NC_015471	TCT	2	6	5273	5278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746793
114	NC_015471	CTT	2	6	5307	5312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746793
115	NC_015471	CAT	2	6	5384	5389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746793
116	NC_015471	CTT	2	6	5403	5408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746793
117	NC_015471	AAG	2	6	5451	5456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746793
118	NC_015471	GCACT	2	10	5504	5513	20 %	20 %	20 %	40 %	331746793
119	NC_015471	TCA	2	6	5671	5676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746793
120	NC_015471	AAG	3	9	5700	5708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746793
121	NC_015471	GTT	2	6	5734	5739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746793
122	NC_015471	AAT	2	6	5884	5889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746793
123	NC_015471	GAG	2	6	5931	5936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	331746793
124	NC_015471	CTC	2	6	5961	5966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746793
125	NC_015471	T	6	6	5982	5987	0 %	100 %	0 %	0 %	331746793
126	NC_015471	CTT	2	6	6030	6035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746793
127	NC_015471	GAA	2	6	6076	6081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746793
128	NC_015471	TCA	2	6	6151	6156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746793
129	NC_015471	TCA	2	6	6166	6171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746793
130	NC_015471	GGCT	2	8	6187	6194	0 %	25 %	50 %	25 %	331746793
131	NC_015471	CT	3	6	6206	6211	0 %	50 %	0 %	50 %	331746793
132	NC_015471	TC	4	8	6297	6304	0 %	50 %	0 %	50 %	331746793
133	NC_015471	GAA	2	6	6317	6322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746793
134	NC_015471	GAGC	2	8	6338	6345	25 %	0 %	50 %	25 %	331746793
135	NC_015471	TGG	2	6	6347	6352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331746793
136	NC_015471	TC	3	6	6395	6400	0 %	50 %	0 %	50 %	331746793
137	NC_015471	TTC	2	6	6423	6428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746793
138	NC_015471	CTTT	2	8	6447	6454	0 %	75 %	0 %	25 %	331746793
139	NC_015471	TCC	2	6	6521	6526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746793
140	NC_015471	GAA	2	6	6646	6651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746794
141	NC_015471	GTT	2	6	6658	6663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746794
142	NC_015471	ATT	2	6	6673	6678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746794
143	NC_015471	ATC	2	6	6748	6753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746794
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145	NC_015471	TGT	2	6	6844	6849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746795
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147	NC_015471	TAAT	2	8	6915	6922	50 %	50 %	0 %	0 %	331746795
148	NC_015471	ACC	2	6	6981	6986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331746795
149	NC_015471	CA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	0 %	50 %	331746795
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161	NC_015471	AATC	2	8	7722	7729	50 %	25 %	0 %	25 %	331746795
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165	NC_015471	AT	3	6	7907	7912	50 %	50 %	0 %	0 %	331746795
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173	NC_015471	TCT	2	6	8748	8753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746796
174	NC_015471	TTTCA	2	10	8762	8771	20 %	60 %	0 %	20 %	331746796
175	NC_015471	TATC	2	8	8860	8867	25 %	50 %	0 %	25 %	331746796
176	NC_015471	TTC	3	9	8981	8989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746796
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253	NC_015471	TCA	2	6	14426	14431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746806
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257	NC_015471	TC	3	6	14793	14798	0 %	50 %	0 %	50 %	331746807
258	NC_015471	TG	3	6	14995	15000	0 %	50 %	50 %	0 %	331746807
259	NC_015471	CAG	2	6	15003	15008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331746807
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263	NC_015471	ATG	2	6	15545	15550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746808
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265	NC_015471	GA	3	6	15577	15582	50 %	0 %	50 %	0 %	331746808
266	NC_015471	TCC	2	6	15635	15640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746808
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397	NC_015471	TCT	2	6	22032	22037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746812
398	NC_015471	TTC	2	6	22062	22067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746812
399	NC_015471	AGT	2	6	22082	22087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746812
400	NC_015471	TGT	2	6	22162	22167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746812
401	NC_015471	CTT	2	6	22203	22208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746812
402	NC_015471	TCC	2	6	22213	22218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746812
403	NC_015471	TCA	2	6	22378	22383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746812
404	NC_015471	CCT	2	6	22412	22417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746812
405	NC_015471	ATT	2	6	22498	22503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746812
406	NC_015471	GTC	2	6	22512	22517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331746812
407	NC_015471	GTGTT	2	10	22545	22554	0 %	60 %	40 %	0 %	331746812
408	NC_015471	AAT	2	6	22556	22561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746812
409	NC_015471	AGTG	2	8	22623	22630	25 %	25 %	50 %	0 %	331746812
410	NC_015471	TA	3	6	22637	22642	50 %	50 %	0 %	0 %	331746812
411	NC_015471	CTT	2	6	22686	22691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746812
412	NC_015471	ATA	3	9	22728	22736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746812
413	NC_015471	TAT	2	6	22755	22760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746812
414	NC_015471	AAT	2	6	22763	22768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746812
415	NC_015471	ATT	2	6	22848	22853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746812
416	NC_015471	T	6	6	22926	22931	0 %	100 %	0 %	0 %	331746812
417	NC_015471	AGA	2	6	22947	22952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746812
418	NC_015471	GTA	2	6	23019	23024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331746812
419	NC_015471	TC	3	6	23075	23080	0 %	50 %	0 %	50 %	331746812
420	NC_015471	TTC	2	6	23151	23156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746812
421	NC_015471	CTT	2	6	23184	23189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746812
422	NC_015471	CAT	2	6	23202	23207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331746812
423	NC_015471	TCC	2	6	23211	23216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746813
424	NC_015471	TCT	2	6	23217	23222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746813
425	NC_015471	CCA	2	6	23253	23258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331746813
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427	NC_015471	GCC	2	6	23360	23365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	331746814
428	NC_015471	AAG	2	6	23367	23372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331746814
429	NC_015471	ATT	2	6	23392	23397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331746814
430	NC_015471	TCT	2	6	23423	23428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331746814
431	NC_015471	ATA	2	6	23460	23465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746814
432	NC_015471	GCC	2	6	23478	23483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	331746814
433	NC_015471	TCC	2	6	23509	23514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746814
434	NC_015471	GA	4	8	23517	23524	50 %	0 %	50 %	0 %	331746814
435	NC_015471	CCT	2	6	23528	23533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746814
436	NC_015471	CTC	2	6	23623	23628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746814
437	NC_015471	TCC	2	6	23642	23647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746814
438	NC_015471	TCC	2	6	23860	23865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746814
439	NC_015471	ATA	2	6	23889	23894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746814
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442	NC_015471	GCCGTT	2	12	23922	23933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331746814
443	NC_015471	CTC	2	6	23942	23947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746814
444	NC_015471	ATA	2	6	24054	24059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331746814
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452	NC_015471	CT	3	6	24340	24345	0 %	50 %	0 %	50 %	331746815
453	NC_015471	TC	3	6	24446	24451	0 %	50 %	0 %	50 %	331746815
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458	NC_015471	TC	3	6	24762	24767	0 %	50 %	0 %	50 %	331746816
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469	NC_015471	TCC	2	6	25314	25319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331746816
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500	NC_015471	CT	3	6	27434	27439	0 %	50 %	0 %	50 %	331746818

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